Objetivo: explorar el uso de teorías y modelos en reportes de investigación de los posgrado del Instituto de Salud Pública (ISP) de la Universidad Nacional de Colombia (UN). Métodos: en junio de 2005, según criterios predefinidos, los trabajos finales de formación en las maestrías en salud pública o en infecciones y salud del trópico del instituto, terminados de enero de 2000 a mayo de 2005, fueron revisados por un lector entrenado en rastrear dicho uso. Resultados: se identificaron y leyeron 50 reportes, 34 en salud pública y 16 en infecciones-salud del trópico, que dedicaron 22 páginas en promedio a plantear un referente teórico. Solo cinco trabajos (10% del material), cuatro de salud pública y uno de infecciones-salud del trópico, usaron la base teórica propuesta según criterios deseables. Conclusiones: el uso de la base teórica para orientar temática, metodológica y analíticamente las investigaciones de posgrado del isp-un, terminadas entre 2000 y 2005, es bajo.