Introduccion: Los escolares son susceptibles a padecer anemia y deficiencia de micronutrientes. No hay reportes del estado del hierro en indigenas del sector urbano. Objetivo: Establecer el estado del hierro en ninos de 5 a 14 anos de edad de seis comunidades indigenas residentes en la ciudad de Cali-Colombia. Sujetos y metodos: Se estudiaron 62 ninos indigenas de 5 a 14 anos de edad, sin antecedentes febriles. Se les midio hemoglobina, hematocrito, volumen corpuscular medio, ferritina y transferrina. Los datos fueron analizados con STATA version 10.0. Se calcularon promedios y desviacion estandar para las variables cuantitativas y para las cualitativas proporciones y distribucion de frecuencia simple. Las comparaciones entre comunidades se realizaron con el Test de Mediana y t de Student. Resultados: Las variables bioquimicas no mostraron distribucion normal frente a las variables hematologicas. Se presentaron diferencias estadisticamente significantes en la hemoglobina y hematocrito entre dos cabildos indigenas. La transferrina fue semejante en todos los cabildos; la ferritina mostro diferencias estadisticamente significantes. La prevalencia de anemia por deficiencia de hierro fue de 25,8%, siendo los Inga y Yanacona los mas afectados. Conclusiones: Los ninos indigenas presentaron deficiencia de hierro, y riesgo para el buen desarrollo fisico y cognitivo. Se debe considerar la intervencion, para establecer las causas y tomar medidas correctivas.