Se ha desarrollado un modelo matemático en dinámica de sistemas para representar las interacciones entomológicas, epidemiológicas y climáticas de la transmisión de la malaria que conducen a brotes epidémicos de la enfermedad en el municipio de Nuquí, departamento del Chocó, sobre la costa pacífica colombiana. Las variables entomológicas exógenas consideradas relevantes para la representación de la incidencia han sido estimadas a partir de bioensayos y campañas de colecta de adultos (peri e intradomiciliarias). La transmisión del parásito entre las poblaciones de mosquitos y humanos durante la alimentación sanguínea ha sido representada a través de tres índices: Tosa de Inoculación Entomológica, Tosa Básica de Reproducción y Capacidad Vectorial, bajo diferentes escenarios de densidad de mosquitos. La representación de la fluctuación estacional de los vectores ha sido posible gracias a la implementación de dos módulos paralelos adicionales: disponibilidad de criaderos e interacciones predador-presa-recursos. El n.odelo ha sido aplicado para el período nov/1997-feb/2001 (1.200 días de horizonte de simulación), durante el cual los eventos El Niño y La Niña afectaron la hidroclimatología del país. El modelo se ha ejecutado para temperaturas humedades relativas promedio diarias, así como valores totales diarios de precipitación registrados por una estación climatológica cercana. En el proceso de experimentación se consideraron diferentes escenarios de temperatura, además de los análisis de sensibilidad e inestabilidad. Los resultados obtenidos permiten concebir el modelo como una herramienta para el entendimiento de las relaciones ecológicas, entomológicas y epidemiológicas que conducen a los brotes epidémicos de la enfermedad.