La enfermedad de Alzheimer es la entidad mas frecuente en pacientes con sindrome Down (SD) y a su vez uno de los factores de riesgo para el desarrollo de esta entidad es la presencia del alelo e4 de apolipoproteina E. En el presente estudio se evaluo el genotipo de apolipoproteina E en un grupo de pacientes de ambos sexos con sindrome Down. Los resultados muestran que hay una frecuencia aumentada para el alelo e4 en esta poblacion cuando se hizo la comparacion con los valores previamente encontrados para una muestra de la poblacion del Departamento de Risaralda que no presentaban SD la cual se tomo como control.