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Genotyping-by-sequencing provides the first well-resolved phylogeny for coffee (Coffea) and insights into the evolution of caffeine content in its species
Acceso Cerrado
Fuente: Molecular Phylogenetics and Evolution
Perla Hamon
Corrinne Grover
Aaron Davis
Jean Jacques Rakotomalala
Nathalie Raharimalala
Victor Albert
Hosahalli Sreenath
Piet Stoffelen
Sharon Mitchell
Emmanuel Couturon
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Temas:
Biology
Genotyping
Phylogenetics
Evolutionary biology
Coffea
DNA sequencing
Phylogenetic tree
Computational biology
Genetics
Botany
Genotype
Gene
Publicado: 2017
Citaciones:
82
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Evaluation of chloroplast genome annotation tools and application to analysis of the evolution of coffee species
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000040358-74
Fuente: PLoS ONE
Christophe Guyeux
jean claude charr
Hue Tm Tran
Agnelo Furtado
Robert J Henry
dominique crouzillat
Romain Guyot
Perla Hamon
Temas:
Biology
Genome
Phylogenetic tree
Coffea arabica
Coffea canephora
Coffea
Phylogenetics
Clade
Evolutionary biology
Botany
Gene
Genetics
Publicado: 2019
Citaciones:
39
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Structure and Distribution of Centromeric Retrotransposons at Diploid and Allotetraploid Coffea Centromeric and Pericentromeric Regions
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000040358-67
Fuente: Frontiers in Plant Science
Renata de Castro Nunes
Simon Orozco Arias
dominique crouzillat
Lukas A Mueller
Suzy R Strickler
Patrick Descombes
Coralie Fournier
Deborah Moine
Alexandre de Kochko
Priscila Mary Yuyama
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Temas:
Retrotransposon
Centromere
Biology
Genome
Genetics
Ploidy
Coffea canephora
Coffea arabica
Chromosome
Heterochromatin
Gene
Botany
Transposable element
Publicado: 2018
Citaciones:
35
Altmétricas:
0
Artículo de revista
The genome and population genomics of allopolyploid Coffea arabica reveal the diversification history of modern coffee cultivars
Acceso Abierto
Fuente: Nature Genetics
Jarkko Salojärvi
Aditi Rambani
Zhe Yu
Romain Guyot
Susan Strickler
Maud Lepelley
Cui Wang
Sitaram Rajaraman
Pasi Rastas
Chunfang Zheng
Mostrar todos
Temas:
Biology
Coffea canephora
Coffea arabica
Domestication
Ploidy
Genomics
Genome
Population
Botany
Genetics
Gene
Demography
Sociology
Publicado: 2024
Citaciones:
35
Altmétricas:
0
Artículo de revista
The absence of the caffeine synthase gene is involved in the naturally decaffeinated status of Coffea humblotiana, a wild species from Comoro archipelago
Acceso Abierto
Fuente: Scientific Reports
Nathalie Raharimalala
Stephane Rombauts
Andrew McCarthy
Andrea Maria Garavito Espejo
Simon Orozco Arias
Laurence Bellanger
Alexa Yadira Morales Correa
Solène Froger
Stéphane Michaux
Victoria Berry
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Temas:
Coffea
Caffeine
Genome
Biology
Coffea arabica
Gene
Theobromine
Coffea canephora
Genome size
Archipelago
Genetics
Whole genome sequencing
Botany
Ecology
Endocrinology
Publicado: 2021
Citaciones:
33
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Complex evolutionary history of coffees revealed by full plastid genomes and 28,800 nuclear SNP analyses, with particular emphasis on Coffea canephora (Robusta coffee)
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000040358-80
Fuente: Molecular Phylogenetics and Evolution
jean claude charr
Andrea Maria Garavito Espejo
Christophe Guyeux
dominique crouzillat
Patrick Descombes
Coralie Fournier
Serigne Ndiawar Ly
Eva Nathalie Raharimalala
Jean Jacques Rakotomalala
Piet Stoffelen
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Temas:
Coffea canephora
Coffea
Biology
Coffea arabica
Nuclear gene
Lineage (genetic)
Phylogenetic tree
Rubiaceae
Botany
Evolutionary biology
Nuclear DNA
Clade
Genome
Genetics
Mitochondrial DNA
Gene
Publicado: 2020
Citaciones:
19
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Distribution of Divo in Coffea genomes, a poorly described family of angiosperm LTR-Retrotransposons
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000040358-40
Fuente: Molecular Genetics and Genomics
Mathilde Dupeyron
rogerio fernandes de souza
Perla Hamon
Alexandre de Kochko
dominique crouzillat
Emmanuel Couturon
Douglas Silva Domingues
Romain Guyot
Temas:
Retrotransposon
Biology
Genome
Transposable element
Coffea canephora
Coffea arabica
Ploidy
Genetics
Long terminal repeat
Genome evolution
Gene
Botany
Publicado: 2017
Citaciones:
9
Altmétricas:
0
Artículo de revista
The genome and population genomics of allopolyploidCoffea arabicareveal the diversification history of modern coffee cultivars
Acceso Abierto
Fuente: bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Jarkko Salojärvi
Aditi Rambani
Zhe Yu
Romain Guyot
Susan Strickler
Maud Lepelley
Cui Wang
Sitaram Rajaraman
Pasi Rastas
Chunfang Zheng
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Temas:
Coffea canephora
Biology
Coffea arabica
Domestication
Ploidy
Genome
Genomics
Population
Botany
Genetics
Gene
Demography
Sociology
Publicado: 2023
Citaciones:
5
Altmétricas:
0
Artículo de revista
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