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Mitch Matoga
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High-throughput nanopore sequencing of Treponema pallidum tandem repeat genes arp and tp0470 reveals clade-specific patterns and recapitulates global whole genome phylogeny
Acceso Abierto
Fuente: Frontiers in Microbiology
Nicole Lieberman
Thaddeus D Armstrong
Benjamin Chung
Daniel Pfalmer
Christopher Hennelly
Austin Haynes
Emily Romeis
Qianqiu Wang
Ruili Zhang
Cai Xia Kou
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Temas:
Biology
Subclade
Tandem repeat
Genetics
Genome
Gene
Phylogenetics
Direct repeat
Clade
Treponema
Whole genome sequencing
Virology
Syphilis
Human immunodeficiency virus (HIV)
Publicado: 2022
Citaciones:
12
Altmétricas:
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Artículo de revista
Clinical and genomic diversity of Treponema pallidum subspecies pallidum to inform vaccine research: an international, molecular epidemiology study
Acceso Abierto
Fuente: The Lancet Microbe
Arlene C Seña, MD, MPH
Mitch Matoga
LIGANG YANG
EDUARDO LOPEZ MEDINA
Farhang Aghakhanian Fereydani
Jane Chen
Everton Bettin
Melissa J Caimano
Wentao Chen
Jonny Alejandro Garcia Luna
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Temas:
Treponema
Subspecies
Early syphilis
Syphilis
Whole genome sequencing
Molecular epidemiology
Epidemiology
Biology
Virology
Genome
Medicine
Computational biology
Genetics
Gene
Internal medicine
Genotype
Zoology
Human immunodeficiency virus (HIV)
Publicado: 2024
Citaciones:
5
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Clinical and genomic diversity ofTreponema pallidum subsp. pallidum:A global, multi-center study of early syphilis to inform vaccine research
Acceso Abierto
Fuente: medRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Arlene C Seña, MD, MPH
Mitch Matoga
LIGANG YANG
EDUARDO LOPEZ MEDINA
Farhang Aghakanian
Jane Chen
Everton Bettin
Melissa J Caimano
Wentao Chen
Jonny Alejandro Garcia Luna
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Temas:
Treponema
Syphilis
Lineage (genetic)
Biology
Whole genome sequencing
Molecular epidemiology
Epidemiology
Serology
Virology
Genome
Medicine
Genetics
Internal medicine
Genotype
Gene
Human immunodeficiency virus (HIV)
Antibody
Publicado: 2023
Citaciones:
3
Altmétricas:
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Artículo de revista
High-throughput nanopore sequencing of Treponema pallidum tandem repeat genes arp and tp0470 reveals clade-specific patterns and recapitulates global whole genome phylogeny
Acceso Abierto
Fuente: bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Nicole Lieberman
Thaddeus D Armstrong
Benjamin Chung
Daniel Pfalmer
Christopher Hennelly
Austin Haynes
Emily Romeis
Qianqiu Wang
Ruili Zhang
Cai Xia Kou
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Temas:
Subclade
Biology
Tandem repeat
Genetics
Genome
Treponema
Clade
Gene
Direct repeat
Phylogenetics
Virology
Syphilis
Human immunodeficiency virus (HIV)
Publicado: 2022
Citaciones:
1
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0
Artículo de revista
O20.4 Evaluation of global Treponema pallidum genetic diversity using representative sampling and high-throughput genomic analysis
Acceso Abierto
Fredrick Nzabanyi Nindo
Petra Pospíšilová
Christopher Hennelly
K Hawley
Anisha Luthra
Tim Rb Davenport
Anthony Sena
W Chen
Yu Jiang
Baozhen Yang
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Temas:
Treponema
Genome
Biology
DNA sequencing
Genetics
Whole genome sequencing
Computational biology
Reference genome
Sequence assembly
Deep sequencing
Clade
Gene
Virology
Phylogenetic tree
Syphilis
Gene expression
Transcriptome
Human immunodeficiency virus (HIV)
Publicado: 2021
Citaciones:
0
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0
Artículo de revista
O07.6 Establishing a global consortium for syphilis vaccine development: patient enrollment and sample procurement for Treponema pallidum genome and OMPeome sequencing
Acceso Abierto
Arlene C Seña, MD, MPH
Bin yang
Lianjuan Yang
Hailin Zheng
Joseph D Tucker
Mitch Matoga
I Hoffman
EDUARDO LOPEZ MEDINA
Lady Giovanna Ramirez
J Chen
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Temas:
Syphilis
Medicine
Treponema
Virology
Internal medicine
Immunology
Human immunodeficiency virus (HIV)
Publicado: 2021
Citaciones:
0
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Artículo de revista
1
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