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An Improved Method for TAL Effectors DNA-Binding Sites Prediction Reveals Functional Convergence in TAL Repertoires of Xanthomonas oryzae Strains
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000596124-108
Fuente: PLoS ONE
Alvaro L Perez Quintero
Luis Miguel Rodriguez Rojas
alexis dereeper
Camilo Ernesto Lopez Carrascal
Ralf Koebnik
Boris Szurek
Sebastien Cunnac
Temas:
Biology
Effector
Xanthomonas oryzae
Xanthomonas
Genetics
Gene
DNA
Computational biology
Transcription factor
Genome
DNA binding site
Promoter
Gene expression
Cell biology
Publicado: 2013
Citaciones:
89
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Regulatory Divergence between Parental Alleles Determines Gene Expression Patterns in Hybrids
Acceso Abierto
Fuente: Genome Biology and Evolution
marie christine combes
Yann Hueber
alexis dereeper
Stéphanie Rialle
Juan Carlos Herrera
Philippe Lashermes
Temas:
Biology
Genetics
Allele
Gene
Hybrid
Regulation of gene expression
Gene expression
Dominance (genetics)
Regulatory sequence
Regulator gene
Botany
Publicado: 2015
Citaciones:
88
Altmétricas:
0
Artículo de revista
SNiPlay3: a web-based application for exploration and large scale analyses of genomic variations
Acceso Abierto
Fuente: Nucleic Acids Research
alexis dereeper
Felix Homa
Gwendoline Andres
Guilhem Sempéré
Gautier SARAH
Yann Hueber
Jean François Dufayard
Manuel Ruiz
Temas:
Biology
Linkage disequilibrium
Single-nucleotide polymorphism
Computational biology
Genetics
Tag SNP
Genotyping
Genotype
Gene
Publicado: 2015
Citaciones:
67
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Allelic variation for broad‐spectrum resistance and susceptibility to bacterial pathogens identified in a rice MAGIC population
Acceso Abierto
Fuente: Plant Biotechnology Journal
Ana Bossa Castro
C Tekete
Chitra Raghavan
Emily Delorean
alexis dereeper
Karim Dagno
Oushmane Koita
Gloria M Mosquera
Hei Leung
valerie VERDIER
Mostrar todos
Temas:
Biology
Quantitative trait locus
Genetics
Population
Xanthomonas oryzae
Plant disease resistance
Allele
Genome-wide association study
Genotype
Single-nucleotide polymorphism
Gene
Demography
Sociology
Publicado: 2018
Citaciones:
40
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Artículo de revista
Gigwa—Genotype investigator for genome-wide analyses
Acceso Abierto
Fuente: GigaScience
Guilhem Sempéré
Florian PHILIPPE
alexis dereeper
Manuel Ruiz
Gautier SARAH
Pierre Larmande
Temas:
Computer science
Scalability
Visualization
Web application
User Friendly
Data science
Data mining
World Wide Web
Database
Operating system
Publicado: 2016
Citaciones:
25
Altmétricas:
0
Artículo de revista
TAL Effector Repertoires of Strains of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis in Commercial Cassava Crops Reveal High Diversity at the Country Scale
Acceso Abierto
Fuente: Microorganisms
Carlos A Zárate Chaves
Daniela Osorio Rodríguez
Rubén E Mora
Alvaro L Perez Quintero
alexis dereeper
Silvia Restrepo Restrepo
Camilo Ernesto Lopez Carrascal
Boris Szurek
Adriana Jimena Bernal
Temas:
Biology
Effector
Gene
Genetics
Xanthomonas
Promoter
Computational biology
Gene expression
Cell biology
Publicado: 2021
Citaciones:
15
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Genomic Relationships among Different Timor Hybrid (Coffea L.) Accessions as Revealed by SNP Identification and RNA-Seq Analysis
Acceso Cerrado
ART-GC_ART
ID Minciencias: ART-0000244040-85
Fuente: Advances in intelligent systems and computing
Juan Carlos Herrera Miranda
Andres Mauricio Villegas Hincapie
Fernando A García Bastidas
alexis dereeper
marie christine combes
Huver E Posada
Philippe Lashermes
Temas:
Introgression
Biology
Coffea arabica
Coffea canephora
Polyploid
Genome
Identification (biology)
Botany
Genetics
Gene
Publicado: 2013
Citaciones:
4
Altmétricas:
0
Publicaciones editoriales no especializadas
Resistance and susceptibility to Xanthomonas phaseoli pv. manihotis in cassava: A transcriptomic comparison (or two sides of the same coin)
Acceso Cerrado
ART-ART_A2
ID Minciencias: ART-0000596124-166
Fuente: Physiological and Molecular Plant Pathology
Edilene Ramírez
alexis dereeper
Adriana Jimena Bernal
Boris Szurek
Camilo Ernesto Lopez Carrascal
Temas:
Biology
Transcriptome
Gene
Transcription factor
Xanthomonas
Gene expression profiling
Plant disease resistance
Gene expression
Genetics
Kinase
Pseudomonas syringae
Cell biology
Publicado: 2020
Citaciones:
3
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Erratum to: Gigwa-Genotype investigator for genome-wide analyses
Acceso Abierto
Fuente: GigaScience
Guilhem Sempéré
Florian PHILIPPE
alexis dereeper
Manuel Ruiz
Gautier SARAH
Pierre Larmande
Temas:
Genotype
Computational biology
Genome
Data science
Computer science
Bioinformatics
Biology
Genetics
Gene
Publicado: 2016
Citaciones:
1
Altmétricas:
0
Artículo de revista
1
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