El objetivo de la investigación consistió en analizar el papel de las políticas públicas de emprendimiento e innovación del Municipio de Medellín entre 2004-2011. El caso de estudio fue la Universidad de Antioquia. La metodología tomó elementos del interaccionismo simbólico para la recolección y el análisis de datos fundamentados en conceptos, categorías, preguntas y comparaciones. Este artículo es producto del proyecto y muestra de forma descriptiva cómo las universidades son un actor líder en el sistema de investigación colombiano, de tal forma que deben potenciar la capacidad para dirigir y controlar los cambios conforme sus propios escenarios, con base en políticas, normatividad, nichos, alianzas y formas asociativas entre diferentes actores. Esto converge en su interacción con el discurso de la tercera misión universitaria.