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Hecho en Colombia
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Programa de Estudio y Control de Enfermedades Tropicales PECET
Grupo Tandem en Nano-bio-física
Universidad de Antioquia
Novo Nordisk
Perfil externo:
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Drug search for leishmaniasis: a virtual screening approach by grid computing
Acceso Cerrado
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000002780-31839
Fuente: Journal of Computer-Aided Molecular Design
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Stanley J Watowich
Andres Felipe Florez Amaya
Carol V Mesa
Sara Maria Robledo Restrepo
Carlos Enrique Muskus Lopez
Temas:
Leishmania
Leishmaniasis
Drug
Drug discovery
Virtual screening
Protein Data Bank (RCSB PDB)
Cutaneous leishmaniasis
Small molecule
Meglumine antimoniate
Biology
Computational biology
Pharmacology
Biochemistry
Immunology
Computer science
Parasite hosting
World Wide Web
Publicado: 2016
Citaciones:
47
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Predicting the Affinity of Peptides to Major Histocompatibility Complex Class II by Scoring Molecular Dynamics Simulations
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000681440-68
Fuente: Journal of Chemical Information and Modeling
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Alessandro LAIO
Pilar Cossio Tejada
Temas:
In silico
Major histocompatibility complex
Computational biology
Ranking (information retrieval)
Logistic regression
Computer science
Chemistry
Biology
Artificial intelligence
Biochemistry
Machine learning
Gene
Publicado: 2019
Citaciones:
42
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Anti-Herpetic, Anti-Dengue and Antineoplastic Activities of Simple and Heterocycle-Fused Derivatives of Terpenyl-1,4-Naphthoquinone and 1,4-Anthraquinone
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0001477456-36
Fuente: Molecules
Vicky Constanza Roa Linares
Yaneth de Jesus Miranda Brand
Veronica Tangarife Castano
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Pablo Anselmo García García
MARIA ANGELES CASTRO
Liliana Amparo Betancur Galvis
Arturo San Feliciano Martin
Temas:
Dengue virus
Cytotoxicity
HeLa
Vero cell
Chemistry
Anthraquinone
Jurkat cells
Stereochemistry
Naphthoquinone
Docking (animal)
Quinone
Cell culture
In vitro
Dengue fever
Virology
Biology
Biochemistry
T cell
Immunology
Organic chemistry
Medicine
Immune system
Nursing
Genetics
Publicado: 2019
Citaciones:
34
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Repurposing of known drugs for leishmaniasis treatment using bioinformatic predictions, in vitro validations and pharmacokinetic simulations
Acceso Cerrado
ART-ART_A2
ID Minciencias: ART-0001347073-64
Fuente: Journal of Computer-Aided Molecular Design
Christian Bustamante Toro
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Claudia Ximena Asela Pinzón
Carlos Enrique Muskus Lopez
Temas:
Miltefosine
Pharmacology
Leishmaniasis
Drug
Drug repositioning
Pharmacokinetics
Repurposing
Medicine
Amphotericin B
Pentamidine
In vivo
Rifabutin
Tropical disease
Leishmania
Biology
Disease
Antibiotics
Parasite hosting
Immunology
Visceral leishmaniasis
Internal medicine
Microbiology
Antifungal
Pneumonia
Biotechnology
Dermatology
Ecology
Clarithromycin
World Wide Web
Computer science
Publicado: 2019
Citaciones:
23
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Application of ensemble pharmacophore-based virtual screening to the discovery of novel antimitotic tubulin inhibitors
Acceso Abierto
Fuente: Computational and Structural Biotechnology Journal
Laura Gallego Yerga
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Isaias Lans Vargas
Carlos Pena Varas
Melissa Alegría Arcos
Pilar Cossio Tejada
David Ramírez Sánchez
Rafael Pelaez Lamamie de Clairac Arroyo
Temas:
Pharmacophore
Virtual screening
Tubulin
Computational biology
Chemistry
Microtubule
Drug discovery
Combinatorial chemistry
In vitro
Colchicine
Stereochemistry
Biology
Biochemistry
Cell biology
Genetics
Publicado: 2021
Citaciones:
20
Altmétricas:
0
Artículo de revista
dockECR: Open consensus docking and ranking protocol for virtual screening of small molecules
Acceso Abierto
Fuente: Journal of Molecular Graphics and Modelling
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Camila Mara Clemente
Natalia S Adler
Temas:
DOCK
Virtual screening
Computer science
Docking (animal)
Ranking (information retrieval)
Computational biology
Protocol (science)
AutoDock
Open source
Source code
Data mining
Machine learning
Chemistry
Bioinformatics
Drug discovery
Biology
Software
In silico
Programming language
Gene
Medicine
Biochemistry
Alternative medicine
Nursing
Pathology
Publicado: 2021
Citaciones:
20
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Perspectives for the structure-based design of acetylcholinesterase reactivators
Acceso Cerrado
ART-ART_A2
ID Minciencias: ART-0000061158-167
Fuente: Journal of Molecular Graphics and Modelling
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Carlos Andres Rodriguez Jaramillo
Andres Felipe Zuluaga Salazar
Temas:
Acetylcholinesterase
Chemistry
Organic chemistry
Enzyme
Publicado: 2016
Citaciones:
19
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Assessing the capability ofin silicomutation protocols for predicting the finite temperature conformation of amino acids
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000681440-58
Fuente: Physical Chemistry Chemical Physics
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Miguel A Soler
Alessandro LAIO
Pilar Cossio Tejada
Temas:
In silico
Conformational isomerism
Molecular dynamics
Mutation
Point mutation
Chemistry
Computational biology
Computational chemistry
Biological system
Computer science
Molecule
Biology
Biochemistry
Organic chemistry
Gene
Publicado: 2018
Citaciones:
19
Altmétricas:
0
Artículo de revista
PARCE: Protocol for Amino acid Refinement through Computational Evolution
Acceso Abierto
Fuente: Computer Physics Communications
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Miguel A Soler
Alessandro LAIO
Pilar Cossio Tejada
Temas:
Computer science
In silico
Python (programming language)
Protocol (science)
Computational biology
Amino acid residue
Binding affinities
Programming language
Peptide sequence
Biology
Genetics
Medicine
Alternative medicine
Receptor
Pathology
Gene
Publicado: 2020
Citaciones:
18
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Artículo de revista
Toxic Activity, Molecular Modeling and Docking Simulations of Bacillus thuringiensis Cry11 Toxin Variants Obtained via DNA Shuffling
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000002844-204
Fuente: Frontiers in Microbiology
Alvaro Mauricio Flórez Escobar
Miguel Orlando Suarez Barrera
Gloria Marcela Morales Manrique
Karen Viviana Rivera
Sergio Ordúz Peralta
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Diego Alexander Guerra Arias
Carlos Enrique Muskus Lopez
Karen Viviana Rivera Rivera
Temas:
Bacillus thuringiensis
DNA shuffling
Aedes aegypti
Biology
Culex quinquefasciatus
DNA
Docking (animal)
Gene
Toxin
Homology modeling
Point mutation
Genetics
Mutation
Biochemistry
Mutant
Directed evolution
Bacteria
Enzyme
Medicine
Botany
Nursing
Larva
Publicado: 2018
Citaciones:
17
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0
Artículo de revista
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